介及入门

Model是一种建立、估计和检验研究系统中多变量间因果关系的模型方法它可以替代多元回归、因子分析、协方差分析等方法利用图形化模型方式清晰展示研究系统中变量间的因果网络关系是近年来地学、生态、进化、环境、医学、社会、经济领域中应用十分广泛的统计方法。

利用开源软件R平台以生态学领域研究问题为主线如生物多样性、物种分布、生物入侵、生物地理格局、生物多样性与生态系统功能BEF、生态恢复、气候变化对物种分布影响等通过理论讲解和实际操作相结合的方式由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程使学员能够利用结构方程模型方法解决实际研究和工作中遇到的相关科学问题。

筛选大量应用结构方程模型的经典案例这些案例来自Nature、Ecology、Ecological

Applications、Ecology

Evolution、Oikos、Ecography等主流期刊多数案例为近期发表成果具有很大的参考和借鉴价值。

内容包括R语言入门、结构方程模型原理介绍、结构方程模型分析入门及高阶应用、潜变量分析、复合变量分析及贝叶斯结构方程模型参数估计。

利用lavaanpiecewiseSEMblavaan及brms程序包分别从全局估计、局域估计及相应贝叶斯估计方法实现结构方程模型分析。

本教程既适合R语言和结构方程模型的初学者也适合对结构方程模型有高阶应用需求的研究生和科研人员。

第一章

2.R语言基本操作包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等

3.R语言数据文件读取、整理清洗、结果存储等含tidverse

4.R语言基础绘图含ggplot基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储

第二章

2.结构方模型估计方法局域估计和全局估计的基本工作原理、主要区别及应用情景分析

and

案例2火烧干扰后植物群落恢复效果评估-数据缺失和正态性不足数据处理-

练习案例环境异质性和资源可获得性对不同演替阶段林下维管植物多样性的影响

第五章

4.案例2城市景观中土地利用对有花植物资源和访花昆虫的直接与间接影响-多个潜变量模型构建

练习案例植物多样性、能量梯度及环境梯度对动物多样性格局的影响-构建动物多样性潜变量

第六章

3.案例1生态力与生物多样性形成机制分析-土壤理化因子的多复合变量构建

4.案例2火烧后植被恢复对物种丰富度影响-复合变量解决非线性问题

5.案例3气候暖化、海平面上升对湿地植物群落的复合影响-复合变量解决交互作用问题

实例讲解植物群落物种多样性是否会提高其对入侵植物的抵抗力-多复合变量实现

第七章

1.piecewiseSEM对内生变量为二项及泊松分布数据的分析

2.混合效应模型时间自相关问题气候波动对海草床生态系统食物网结构影响

4.系统发育相关问题物种属性、社会性进化特征对海虾领域范围和多度影响-

5.分组数据、交互作用、非线性关系问题分析实例数据同章节4和6

练习案例人类活动、环境条件、物种属性对动物领域大小相对贡献-分组分析和分类变量处理

第八章

3.案例1气候及生态位重叠程度对田鼠物种丰富度影响模型比较、直接和间接效应计算blavaan

4.案例2火烧后对植被恢复影响因素-模型拟合、模型比较和评估brms

练习案例生物地理历史因素对北半球森林的初级生产力的影响brms

注请提前安装所需软件