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96SEO 2026-02-23 14:52 3
0">导读：当热图褪去方正的色块，化为一片星罗棋布的圆形矩阵，数据的呈现便瞬间轻盈而灵动。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/9cf0e400dd0a4e8eb3a477abcb19dbf5.png"
justify">《Phytomedicine》文章Cannabidiol
2A的圆点热图展示了三组间差异基因的表达情况，红色表示表达相对较高，蓝色表示表达相对较低。
此图不是以常规的小矩形展示热图，而是采用圆点来展示，星罗棋布，令人耳目一新。
1)">1 1)">， 1)">打开作图URLstyle="color:
style="color:
1)">https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_special_shape_heatmap_289
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/37d39e41c7a047988b4f5c304c1499ff.png"
1)">图2.绘图页面
1)">2 1)">，示例数据style="color:
1)">点击图片上方的示例数据，下载，并应用excel打开。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/a846f1443b244bf0ab3f29e5a0758e9b.png"
1)">矩阵形式。
就是示例数据
1)">组名就是第1行
1)">第2行是样品名，不能有重复
1)">每个基因在每个样品中的表达值，基因名不能有重复，同时不能有空的单元格就是第3+行
1)">3 1)">，输入检查style="color:
1)">点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。
1)">数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/4649b76a7a7a4f95acfe37290fe26cec.png"
1)">通过然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。
若检查不经过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查借助（如下图所示），然后能够继续选择其他参数。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/ead0ee8502ec457e8ededac2c7f46a71.png"
1)">图5.输入检查结果
1)">注： 1)">是新添加的特性，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，以确保素材符合模块输入要求。 1)">4 1)">，选择参数style="color:
style="margin-left:
style="color:
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/3b3bca6c34aa439499f81e867f23705a.png"
1)">图6.绘图参数
1)">图片大小
1)">包括图片宽度和图片高度。
由于每个小圆点的长宽是固定的，因此若图片设置太小则会被截断，不会按比例缩放至指定大小
1)">colorbar 1)">颜色和名字style="color:
1)">给出了低、中、高三种颜色的渐变
1)">名字：要是选择zscore转换，则默认是zscore；如果不选择zscore，则按照页面上填写的名字
1)">分组颜色
1)">热图顶部分组的色块颜色，按照分组在内容中出现的顺序，默认最多绘制6组
1)">文字/字体大小
1)">设置了组名字体大小，旋转角度，基因名字体大小，圆点上标注数值的字体大小（默认两位小数）
1)">角度和大小
1)">设置了内部形状的相对大小，数值越大，则圆点半径越大
1)">通过形状旋转角度：针对三角形，菱形等，可以对形状进行旋转，例如针对三角形时，借助调整旋转角度，能够让顶点朝上，或者朝下
1)">数据zscore转换
1)">默认对数据进行zscore转换；选择原始值时，不进行转换
1)">形状
1)">设置了三角形，菱形，正方形，五边形，六边形，圆形，椭圆等供选择
1)">行聚类、列聚类
1)">设置了是否进行行或者列的聚类
1)">分隔（split）
1)">设置了按照组进行列分隔；设置了按照指定的个数进行行分隔，也就是根据聚类情况，使用灰色的线分别框起来
1)">标注数值
1)">原始值就是是否在圆点上标注数值。
若选择了zscore转换，则标注的是zscore的值；若选择的是原始值，那么标注的就
1)">字体
Roman和Arial。
如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat
illustrator或者inkscape进行编辑修改
1)">5 1)">，提交出图style="color:
1)">检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约3s后，会在页面上显示圆点热图。
我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/8e82503a65b24bc5beddcd94f6f1117e.png"
Illustrator等软件编辑矢量图（pdf或svg），进行组图，调整文字、图像元素位置，字体，添加说明等操作，以满足个性化需求。
src="https://i-blog.csdnimg.cn/direct/96d6cabdcee9418897852b98ad4ad34a.png"
1)">图8.其他形状热图（三角形，菱形，五边形，六边形）
0">微生信助力高分文章，用户350000+，谷歌学术8600+
class="post-meta-container">
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