和Rstudio入门和绘图含ggplot

专题八贝叶斯非线性关系数据分析广义可加混合模型BGAM/BGAMM和非线性混合(BNLM/BNLMM)模型

专题九贝叶斯结构方程模型BSEM

贝叶斯统计已经被广泛应用到物理学、生态学、心理学、计算机、哲学等各个学术领域其火爆程度已经跨越了学术圈如促使其自成统计江湖一派的贝叶斯定理在热播美剧《The

Big

Theory》中都要秀一把。

贝叶斯统计学即贝叶斯学派是一门基本思想与传统基于频率思想的统计学即频率学派完全不同的统计学方法它在统计建模中具有灵活性和先进性特点使其可以轻松应对复杂数据和模型结构。

然而很多初学者在面对思想、技术和方法都与传统统计学有着较大区别的贝叶斯统计以及其后验参数获取需要用到的马尔科夫、蒙特卡罗和吉布斯等现代抽样技术特别是建模中复杂而令人眼花缭乱的脚本文件而畏葸不前。

为了能够让广大研究者准确灵活的应用贝叶斯统计学实现弯道超车跑步进入贝叶斯统计世界特别开展R语言生态环境数据贝叶斯统计高级实践课程。

本文包括回归及结构方程模型概述及数据探索R和Rstudio简介及入门和作图基础R语言数据清洗-tidyverse包贝叶斯回归与混合效应模型贝叶斯计数数据分析、贝叶斯空间、时间及系统发育相关数据分析贝叶斯非线性数据分析;贝叶斯结构方程模型及统计结果绘图等。

本文不仅适合R语言和生态环境数据统计分析初学者更适合有高阶应用需求的研究生和科研人员。

将通过大量实例讲解使大家能应对科研工作中复杂数据局面选择合适模型提高数据分析能力。

【内容简述】

2R语言基本操作包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等

3R语言数据文件读取、整理、结果存储等

4R语言基础绘图含ggplot基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储

1tidyvese简介tidyr、dplyr、readr、%%等

1贝叶斯统计简介

2贝叶斯时间自相关分析线性及混合效应模型及时间自相关方差异质性

4贝叶斯系统发育相关分析

专题八贝叶斯非线性关系数据分析广义可加混合模型BGAM/BGAMM和非线性混合(BNLM/BNLMM)模型

专题九贝叶斯结构方程模型BSEM

(1)R语言贝叶斯SEM实现程序包blavaan和brms介绍

(2)案例1气候及生态位重叠程度对田鼠物种丰富度影响模型比较、直接和间接效应计算blavaanbrms

(3)案例2火烧后对植被恢复影响因素-模型拟合、模型比较和评估brms

(4)案例3生物地理历史因素对北半球森林的初级生产力的影响brms

专题十超越贝叶斯统计因果推断

贝叶斯回归模型结果图散点图、预测图、箱线图、柱状图、提琴图、密度图及峰峦图等

贝叶斯结构方程模型结果图表达

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